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【云回顧】神奇的小分子藥物—PROTAC

2020-03-31
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從近年來(lái)的創(chuàng)新藥研發(fā)和銷(xiāo)售市場(chǎng)來(lái)看,生物藥占盡風(fēng)頭,小分子藥物由于作用機(jī)理的種種局限,無(wú)法作用于所有的藥物靶點(diǎn)而日漸式微。

PROTAC的問(wèn)世為解決小分子藥物的這一局限帶來(lái)了極大的潛力,為靶向傳統(tǒng)小分子藥物所不可成藥的靶點(diǎn)帶來(lái)了解決方案。

2017年以后,PROTAC技術(shù)飛速發(fā)展,從實(shí)驗(yàn)室走向工業(yè)界,從Harvard大學(xué),Yale大學(xué)開(kāi)始, Arvinas公司, C4公司, Kymera Therapeutics公司相繼成立專(zhuān)門(mén)從事PROTAC技術(shù)藥物研究,得到約20億美元的資金,藥物研發(fā)巨頭均紛紛加入該行列,包括輝瑞,羅氏,GSK,默克,諾華,默沙東、艾伯維、吉利德、百時(shí)美施貴寶等。

        2019年3月,Arvinas公司宣布其開(kāi)發(fā)的用于治療前列腺癌的雄激素受體(AR)降解劑ARV-110進(jìn)入Ⅰ期臨床試驗(yàn),這是公開(kāi)報(bào)道的第一個(gè)進(jìn)入Ⅰ期臨床試驗(yàn)的PROTAC分子,標(biāo)志著PROTAC技術(shù)的研究進(jìn)入新的階段。

3月13日美迪西化學(xué)部副總裁馬興泉博士在“美迪西云講堂”與各界同仁們分享了關(guān)于PROTAC技術(shù)的精彩講解,下文對(duì)馬博士的課程做了簡(jiǎn)單的回顧,各位可以掃描下方二維碼或點(diǎn)擊文末的“閱讀原文”,進(jìn)入視頻回放鏈接,觀看完整視頻!

    01 小分子藥物的瓶頸
    傳統(tǒng)的小分子抑制劑的作用機(jī)制是通過(guò)結(jié)合靶蛋白的活性位點(diǎn)從而抑制靶蛋白的功能,100多年來(lái)小分子的研發(fā)思路成功對(duì)抗了很多疾病。但小分子成藥的技術(shù)也面臨著諸多的限制和挑戰(zhàn),例如小分子藥物會(huì)出現(xiàn)耐藥性,無(wú)法長(zhǎng)期抑制靶向蛋白的活性;且小分子藥物需要維持一定的體內(nèi)藥物濃度才能發(fā)揮作用;另外,還有很多靶點(diǎn)被認(rèn)為是小分子所無(wú)法靶向的,如一些轉(zhuǎn)錄因子,骨架蛋白和無(wú)藥可治的突變靶點(diǎn)KRAS等。
    單抗雖然相對(duì)于小分子具有高親和力和高選擇性的優(yōu)勢(shì),但其最大弊端在于無(wú)法透過(guò)細(xì)胞膜,因此無(wú)法作用于細(xì)胞內(nèi)靶點(diǎn)。RNAi可以透過(guò)細(xì)胞膜,并對(duì)靶點(diǎn)有強(qiáng)作用力,然而由于其代謝不穩(wěn)定及脫靶效應(yīng)等弊端,發(fā)展進(jìn)程也是困難重重。
    然而PROTAC技術(shù)的出現(xiàn)給小分子藥物的瓶頸帶來(lái)了曙光,似乎可以完美地解決小分子藥物面臨的諸多難題。

PROTAC技術(shù)

    02 神奇的小分子藥物技術(shù)-PROTAC
    PROTAC是PROteolysis TArgeting Chimeras的縮寫(xiě),意為蛋白水解靶向嵌合體,屬于蛋白質(zhì)降解技術(shù)的一個(gè)新分支。PROTAC技術(shù)的原理征用了自然的細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解過(guò)程。蛋白降解在細(xì)胞的正常生命活動(dòng)中是至關(guān)重要且被嚴(yán)格調(diào)控的,其過(guò)程主要是通過(guò)泛素化酶系統(tǒng)的參與而完成的。需要被分解的蛋白質(zhì)通過(guò)E1、E2和E3泛素連接酶系統(tǒng)標(biāo)記,進(jìn)而被蛋白酶識(shí)別并降解。
    PROTAC分子是一類(lèi)具有啞鈴型結(jié)構(gòu)的雙功能活性化合物,分子的一個(gè)活性端可以與靶蛋白緊密結(jié)合,并通過(guò)連接鏈linker連接到另一個(gè)活性端用來(lái)與E3泛素連接酶相結(jié)合。這種雙功能分子在體內(nèi)可以分別識(shí)別靶蛋白和E3泛素連接酶,將靶蛋白和E3泛素連接酶拉近,靶蛋白被泛素化后,在體內(nèi)通過(guò)泛素-蛋白酶體途徑降解。靶蛋白降解后,PROTAC分子又可以被釋放出來(lái)參與到下一個(gè)蛋白的降解過(guò)程,因此這種降解作用具有催化效果,較少的藥物劑量就可以實(shí)現(xiàn)高效的降解。

神奇的小分子藥物技術(shù)-PROTAC

    03 PROTAC技術(shù)的發(fā)展歷程

PROTAC技術(shù)的發(fā)展歷程

    2001年加州理工大學(xué)的Raymond J. Deshaies教授和耶魯大學(xué)的Craig M. Crews教授首次提出了PROTAC的概念,他們報(bào)道了利用一段肽段與小分子的連接物可以人為調(diào)控目的蛋白的表達(dá)水平。2004年,Crews和Alessio Ciulli等人設(shè)計(jì)并改造了VHL(E3泛素連接酶復(fù)合物CRL2VHL的一部分)的配體,獲得了具有高親和力的VHL的配體,與VHL的結(jié)合力可以達(dá)到納摩爾級(jí)別。利用這種小分子配體,Crews課題組于2015年報(bào)道了雌激素相關(guān)受體α(ERRα)和RIPK2 的PROTAC分子,都可以在細(xì)胞水平觀察到靶蛋白的降解。Crews教授在2013年建立了Arvinas,公司使用PROTAC平臺(tái)構(gòu)建廣泛的蛋白質(zhì)降解產(chǎn)物候選管道,以針對(duì)各種器官系統(tǒng)和組織中的疾病,是PROTAC分子發(fā)展的龍頭公司,目前ARV-110和ARV-471推進(jìn)到 I 期臨床試驗(yàn)中。

PROTAC研究

    04 PROTAC研究中的要素
    PROTAC發(fā)揮藥效必須與靶蛋白和E3酶形成有效的三元復(fù)合物,而此過(guò)程對(duì)PROTAC來(lái)說(shuō),首先需要成功的通過(guò)細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞,其次要考慮如何控制濃度以避免藥物分子與靶蛋白和E3酶分別形成二元復(fù)合物(hook effect),以及充分考慮靶蛋白與E3酶接觸區(qū)域的電荷排斥和立體結(jié)構(gòu)排斥,顯得非常重要。而當(dāng)三元復(fù)合物形成后,能否有效降解,還需要與去泛素化酶以及靶蛋白重合成作斗爭(zhēng),直到達(dá)成一定程度的平衡。
    其次,E3泛素連接酶的選擇也尤為關(guān)鍵。已知大約有600個(gè)E3泛素連接酶可以調(diào)控蛋白酶體的功能,這就為蛋白質(zhì)靶向治療提供了無(wú)限機(jī)會(huì)。由于靶向蛋白降解的整個(gè)過(guò)程依賴(lài)于配體誘導(dǎo)的接近性,因此E3泛素連接酶與靶蛋白在時(shí)空上的共定位是至關(guān)重要的,組織表達(dá)、亞細(xì)胞定位和調(diào)控的差異都可能帶來(lái)潛在的陷阱和機(jī)會(huì)。
    除了重新利用不同連接酶存在的生物學(xué)差異外,目前可用的連接酶之間還存在著一些物理化學(xué)方面的差異,如何獲得合適的物理化學(xué)性質(zhì)以及吸收、分布、代謝和排泄(ADME)特性,使之足以口服給藥和/或甚至達(dá)到中樞神經(jīng)系統(tǒng)是極其重要的。

PROTAC研究中的要素

    05 美迪西PROTAC研究平臺(tái)
    美迪西科研團(tuán)隊(duì)建立了PROTAC藥物發(fā)現(xiàn)技術(shù)平臺(tái),匯總了當(dāng)前流行的熱門(mén)的靶標(biāo)蛋白配體, 建立了廣泛的熱門(mén)靶向蛋白高度親和力小分子及小分子片段化合物庫(kù)(TPSM),廣泛的E3連接酶高度親和力的小分子及小分子片段(E3SM);建立了linker系統(tǒng),包括收集大量具有廣泛多樣性的雙官能團(tuán)連接體(BF-Linker)。這些積累的化合物庫(kù)可以幫助快速高效的合成大量高活性PTROTAC雙特異性小分子,極大地提高采用PROTAC技術(shù)進(jìn)行的藥物研發(fā)過(guò)程。除了快速合成之外,我們同時(shí)建立和完善的PROTAC生物篩選與測(cè)試平臺(tái),后續(xù)發(fā)展到臨床前所有階段。我們的目標(biāo)是建立起的技術(shù)平臺(tái)能同時(shí)承擔(dān)10到20個(gè)PROTACT研發(fā)項(xiàng)目,每年能幫助產(chǎn)生10到20個(gè)PROTAC候選藥物。
    美迪西的PROTAC研究平臺(tái)已經(jīng)與多家生物醫(yī)藥公司建立了技術(shù)服務(wù),部分項(xiàng)目已經(jīng)推進(jìn)到臨床前研究階段?!皩?zhuān)注創(chuàng)新,用心服務(wù)”,經(jīng)過(guò)不斷創(chuàng)新和完善,美迪西PROTAC研究平臺(tái)已有能力進(jìn)一步承接大量的PROTAC技術(shù)研究,提供一站式的研發(fā)服務(wù)。

美迪西云講堂

    THE END

    往期精彩回顧
    美迪西云講堂第01講:
    美迪西云講堂第02講:
    美迪西云講堂第03講:
    美迪西云講堂第04講:
    美迪西云講堂第05講:
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