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背后的思考 | 消失的晶型

2025-04-22
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前言

當(dāng)一種化合物表現(xiàn)出多晶型現(xiàn)象(即存在一種以上的晶體結(jié)構(gòu)時(shí)),在獲得特定已知形式的晶體或?qū)嶒?yàn)難以重復(fù)性方面存在困難的情況比比皆是。確實(shí),有些情況下,即使某種晶型之前在很長一段時(shí)間內(nèi)經(jīng)常被獲得,但后來卻難以再次獲得。顯然已被更穩(wěn)定的多晶型所取代。雖然,并非所有藥物都會(huì)發(fā)生這種情況,但其他藥物確實(shí)經(jīng)歷過類似問題。

本文將就歷史上幾個(gè)著名的消失的晶型案例和美迪西固態(tài)研究團(tuán)隊(duì)遇到的消失的晶型事件作一個(gè)簡單的梳理。

消失的多晶型案例

案例一:利托那韋

最著名的多態(tài)消失的例子非利托那韋莫屬,這是一種抗病毒化合物,由雅培實(shí)驗(yàn)室于1996年以半固體凝膠膠囊的形式銷售,用于治療獲得性免疫缺陷綜合征(艾滋?。?。膠囊是基于在開發(fā)過程中發(fā)現(xiàn)的唯一已知的晶體形式,即Form I。

然而,1998年,利托那韋在半固態(tài)凝膠膠囊中意外地析出了一種新的、可溶性明顯較低的多晶形態(tài),這種被稱為Form II。此外,研究發(fā)現(xiàn),在引入Form II的任何實(shí)驗(yàn)室中,再也不能制備出Form I。甚至有人猜測,在實(shí)驗(yàn)室中,F(xiàn)orm I轉(zhuǎn)化為Form II僅僅是因?yàn)橛袀€(gè)人之前接觸過Form I(或后來被證明能夠形成Form II的污染物)。由于這件事件,利托那韋不得不暫時(shí)退出市場。

Form II形成的可能原因:異質(zhì)成核。具體就是,發(fā)現(xiàn)利托那韋在堿催化反應(yīng)中降解形成一種含氨基甲酸酯的產(chǎn)物如下圖,其結(jié)構(gòu)與II型利托那韋的構(gòu)象相關(guān)。還發(fā)現(xiàn)該降解產(chǎn)物形成速度非??欤⑶矣捎谄浞€(wěn)定性更高,其溶解度低于利托那韋。最終得出結(jié)論,該降解產(chǎn)物可能從經(jīng)歷溶劑損失的利托那韋母液中結(jié)晶出來,然后作為Form II的晶種。

案例一 利托那韋.webp

案例二:LAB687

晶型消失的另一個(gè)典型案例來自諾華公司(Novartis)的LAB687,LAB687是一種微粒體甘油三酯轉(zhuǎn)移蛋白(MTP)抑制劑,旨在降低甘油三酯和低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)。其多晶型形式的發(fā)現(xiàn)與分子的合成工藝開發(fā)密切相關(guān)。在早期開發(fā)階段,LAB687可結(jié)晶為兩種晶型Form A和Form B。利用早期合成路線生產(chǎn)的原料藥(Form A)開展了系統(tǒng)的多晶型篩選,另外發(fā)現(xiàn)Form C。由于Form B無法重復(fù)制備,F(xiàn)orm A和Form C具有相似的溶解度和物理穩(wěn)定性,但Form C比Form A具有更好的過濾和流動(dòng)性能, Form C最終被選定為后續(xù)開發(fā)的目標(biāo)晶型。然而,當(dāng)中試放大已知可穩(wěn)定生產(chǎn)Form C的結(jié)晶工藝至千克級(jí)別時(shí),意外出現(xiàn)了Form D。自從Form D出現(xiàn)以后,F(xiàn)orm A和Form C便無法再重復(fù)制備。

案例二 LAB687.webp

到目前也不清楚出現(xiàn)Form D的真正原因,推測是換了新的合成路線產(chǎn)生了二聚體尿素副產(chǎn)物(雜質(zhì))如下圖,導(dǎo)致了Form D的產(chǎn)生,而通過其他合成途徑獲得的批次中,不存在這個(gè)雜質(zhì)。

案例二 LAB687 純度.webp

案例三:鹽酸雷尼替丁

鹽酸雷尼替丁為長效H2受體拮抗劑。Allen & Hanbury于1977年發(fā)現(xiàn)的雷尼替丁和其鹽酸鹽,1978年獲得美國專利。在隨后的近四年中,該藥物的進(jìn)一步開發(fā)涉及在公司的中試車間進(jìn)行批次放大生產(chǎn),規(guī)模達(dá)到公斤級(jí)別,其化學(xué)工藝基本沿用了前期方法,均為Form 1。1980年4月15日生產(chǎn)了一批次的,紅外檢測發(fā)現(xiàn)在1045 cm-1的位置出現(xiàn)了一個(gè)之前從未觀察到的未知峰,形成了一種新的晶體形式,將其命名為Form 2,隨后多批次出現(xiàn)Form 2,相同的制備工藝,無論怎么嘗試都無法制備出之前的Form1 (原始晶型)。

案例三 鹽酸雷尼替丁.webp

案例四:美迪西案例—某新藥A

該新藥為抗腫瘤藥。早期為了拿到少量樣品盡快開展固態(tài)研究,采用合成通路線的方法制備的一批物料,作為晶篩起始物料,開展多晶型篩選試驗(yàn),共觀察到9種晶型,理化性質(zhì)表征和晶型鑒定顯示新晶型中包括水合物Form 1/ 3、無水物Form 2/ 9、DMSO溶劑合物Form 6、NMP溶劑合物Form 8和亞穩(wěn)晶型Form 4/ 5/ 7。

綜合篩選和評(píng)估結(jié)果,最終確定Form 2作為優(yōu)勢晶型進(jìn)行后續(xù)開發(fā)。然而,意料不到的事情發(fā)生了,合成工藝路線優(yōu)化完之后,用新的路線制備的樣品再去重復(fù)制備Form 2,結(jié)果發(fā)現(xiàn)無法重復(fù)獲得,同時(shí)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)之前晶篩未發(fā)現(xiàn)的新晶型,命名為Form 10。經(jīng)調(diào)查,美迪西固態(tài)研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)早期用于晶篩的樣品和后期開發(fā)的樣品雜質(zhì)譜不一樣,早期樣品純度更低,另外在外觀上也有明顯的不同,早期用于晶篩的樣品為灰白色,而后期開發(fā)的樣品為類白色。

美迪西案例—某新藥A.webp

美迪西案例—某新藥A 分子圖.webp

案例五:美迪西案例—某新藥B

該新藥為抗腫瘤藥。早期多晶型篩選試驗(yàn),共觀察到25種晶型,包括水合物Form 1、溶劑合物Form 4/ 5/ 6/ 11/ 12/ 13/ 14/ 15/ 18/ 19/ 20/ 21/ 22/ 24/ 25和亞穩(wěn)晶型Form 2/ 3/ 7/ 8/ 9/ 10/ 16/ 17/ 23。

綜合篩選和評(píng)估結(jié)果,水合物Form 1被選為優(yōu)勢晶型進(jìn)行后續(xù)開發(fā)。在后來的小試批次開發(fā),F(xiàn)orm 1卻再也無法重復(fù)獲得,出現(xiàn)了一個(gè)晶篩未發(fā)現(xiàn)的新晶型,命名為Form 26。Form 1和Form 26均為水合物,F(xiàn)orm 26的水合量比Form 1更高。為什么晶篩的時(shí)候未能發(fā)現(xiàn)更高水含量的水合物Form 26,美迪西固態(tài)研究團(tuán)隊(duì)初步分析,晶型篩選的開展時(shí)間是在2月份,環(huán)境濕度比較低(小等于30%RH),而小試批次生產(chǎn)是在夏季,環(huán)境相對(duì)濕度相對(duì)更高(大等于60%RH)。項(xiàng)目組推測是環(huán)境相對(duì)濕度變大所致。

美迪西案例—某新藥B.webp

消失的晶型這一現(xiàn)象如何發(fā)生至今仍是個(gè)謎,沒有一個(gè)確切的定論。有人認(rèn)為是晶種(不一定與要結(jié)晶的化合物由相同的分子組成),指的是一粒微小且非預(yù)期的晶體結(jié)構(gòu)模板。這顆晶種,無人知曉其從何而來,實(shí)驗(yàn)室中微量雜質(zhì)(雜質(zhì)譜和雜質(zhì)水平反生變化)或環(huán)境粉塵(塵埃、煙霧顆粒和其他小的異物)即可充當(dāng)晶種,導(dǎo)致晶型失控。從這些消失的晶型案例背后的思考,給筆者的幾點(diǎn)啟示:

? 晶型研究需要早期介入,臨床前階段開始晶型篩選,避免后期因晶型問題返工。盡可能進(jìn)行系統(tǒng)、徹底、可靠、全面的晶型篩選,盡可能地找到更多潛在的晶型,并確定優(yōu)勢晶型進(jìn)行研究。
? 開發(fā)“正確”的固體形式對(duì)于產(chǎn)品的成功至關(guān)重要。盡量做到首次正確。
? 建立雜質(zhì)-晶型關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫,預(yù)判高風(fēng)險(xiǎn)雜質(zhì),雜質(zhì)譜的變化(雜質(zhì)類型和雜質(zhì)水平)對(duì)晶篩結(jié)果的影響,雜質(zhì)可以通過影響成核和生長速率來影響它們在溶液和懸浮液中的動(dòng)力學(xué)穩(wěn)定性。因此,用早期批次的仍含有許多雜質(zhì)的原料藥進(jìn)行的多晶型篩選可能與用較晚、較純的批次進(jìn)行的篩選獲得不同的結(jié)果。
? 晶型篩選和工藝優(yōu)化一樣,是一個(gè)持續(xù)優(yōu)化的過程,不能一蹴而就,從IND到上市前需要開展2-3輪的多晶型篩選?;蛘哂米罱KGMP工藝生產(chǎn)的一批具有待上市產(chǎn)品的雜質(zhì)特征原料藥,至少重復(fù)有限的多晶型篩選。
? 重視環(huán)境對(duì)晶型篩選的影響。實(shí)驗(yàn)室中微量雜質(zhì)或環(huán)境粉塵即可充當(dāng)晶種,導(dǎo)致晶型失控。關(guān)注環(huán)境的溫濕度對(duì)晶型篩選結(jié)果的影響。
? 合成工藝路線發(fā)生變更,工藝路線確定前需全面評(píng)估合成變更對(duì)晶型的影響。最終的合成路線一旦選定,需進(jìn)行額外的多晶型篩選研究,以尋找由于原料藥雜質(zhì)譜變化而產(chǎn)生的潛在新晶型。
? 動(dòng)態(tài)監(jiān)控,從臨床前開發(fā)到臨床,再到上市以及上市后仍然需要持續(xù)監(jiān)測晶型穩(wěn)定性。
? 新晶型可申請(qǐng)專利延長保護(hù)期,必須提前布局,通過文獻(xiàn)或?qū)@暾?qǐng)公開非優(yōu)選晶型,限制競爭對(duì)手的專利空間。
? 無論進(jìn)行多么徹底的篩選,仍然存在一個(gè)不可避免的問題:該化合物的所有晶型都已經(jīng)發(fā)現(xiàn),以及目前是否真的找到了最穩(wěn)定的形式。

結(jié)語

消失的晶型是真的消失了嗎?
答案是否定的,早在1995年一篇文獻(xiàn)中,Jacewicz and Nayler表達(dá)了他們的觀點(diǎn),亞穩(wěn)晶型的消失只是局部和暫時(shí)的現(xiàn)象,任何獲得過的晶體形式都應(yīng)該能夠被重新制備,只是暫時(shí)沒有找到合適的條件。

為什么在相當(dāng)長一段時(shí)間后,仍然會(huì)出現(xiàn)更穩(wěn)定的晶型(之前認(rèn)為穩(wěn)定的晶型消失),沒有親身經(jīng)歷過這種現(xiàn)象的人,對(duì)消失的多態(tài)和無意播種的作用可能是持懷疑態(tài)度的,甚至不相信,但是這種現(xiàn)象的確就發(fā)生在我們的身邊。種子晶體,它們在空氣中,你看不到它們,你聞不到它們,你也無法探測到它們,但它們就在哪里。多晶型現(xiàn)象無法預(yù)測,你永遠(yuǎn)不知道是否還有更穩(wěn)定的晶型存在,這也是目前藥物晶型研究難以克服的困難之一。就藥物固態(tài)研發(fā)這一環(huán)節(jié)來說,我們可以做的是:盡量減少后續(xù)藥物開發(fā)中轉(zhuǎn)晶(原晶型的消失,新的更穩(wěn)定的晶型出現(xiàn))的風(fēng)險(xiǎn)存在。

參考文獻(xiàn):
[1]. Dejan-Kre?imir Bu?ar, et al. Disappearing polymorphs revisited. Angew Chem Int Ed Engl. 2015 Jun 8;54(24):6972-93. doi: 10.1002/anie.201410356.
[2]. Jack D. Dunitz and Joel Bernstein. Disappearing Polymorphs. Acc. Chem. Res. 1995,28, 193-200.
[3]. Mahavir Prashad, et al. Process Research and Development of a MTP Inhibitor: Another Case of Disappearing Polymorphs upon Scale-up. Organic Process Research & Development 2010, 14, 878-882.

關(guān)于美迪西藥物固態(tài)研究服務(wù)平臺(tái)

美迪西工藝部藥物固態(tài)研究服務(wù)平臺(tái)致力于新藥與仿制藥開發(fā)中的晶型研究服務(wù),可提供鹽型、多晶型篩選,單晶培養(yǎng)和結(jié)構(gòu)解析,結(jié)晶工藝開發(fā),手性拆分以及晶型的定性定量分析等服務(wù),助力醫(yī)藥研發(fā)。

美迪西藥物固態(tài)研究優(yōu)勢:
(1)固態(tài)研究人員擁有豐富的鹽型/共晶篩選、晶型篩選以及結(jié)晶工藝開發(fā)經(jīng)驗(yàn);
(2)擅長原料藥及制劑中藥物分子的固體形態(tài)研究及控制;
(3)從藥物發(fā)現(xiàn)到IND申報(bào)一站式醫(yī)藥臨床前研發(fā)服務(wù),賦予固態(tài)篩選團(tuán)隊(duì)更加系統(tǒng)的晶型(鹽型)評(píng)估。

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