腫瘤最重要的一個特點就是脫氧胞嘧啶甲基化形成5-甲基胞嘧啶（5mC）。DNA甲基化是一個甲基添加到DNA分子上的過程。
目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)5mC的出現(xiàn)和分布對基因調(diào)節(jié)很重要，它也可以作為診斷的關鍵生物標記物。因此研究DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄之間的關系對于揭示細胞反應以及新藥開發(fā)很重要。

大量的DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄分析已經(jīng)產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)，但是從中找出和癌癥發(fā)展相關的關鍵基因卻很困難。為了解決這個問題，來自日本大阪大學的研究人員使用高斯方程將大量的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為平滑函數(shù)，從中提取出合適的信息——可以代表5mC甲基化水平的信息。

“腫瘤中包含一種叫做腫瘤干細胞（CSCs）的細胞，它們可以自我更新,具有致癌性，并在化療和放療耐藥性中發(fā)揮著重要作用。”這篇發(fā)表在《Science Reports》上的研究的第一作者Masamitsu Konno解釋道。“因此我們想通過CSC模式酶鳥氨酸脫羧酶確定胞內(nèi)5mC的情況，以找到治療靶標?！?br />
一種新的計算方法將基因表達水平和甲基化修飾數(shù)據(jù)整合在一起，使得研究人員成功地發(fā)現(xiàn)TRAF4是一個重要的化療耐藥基因。通過這種方法，研究人員還確定了幾種治療人胃腸癌（包括食管癌）的藥物的效果。已有許多研究報道某些腫瘤（如乳腺、肺部及前列腺腫瘤）中TRAF4表達異常，但是這是首個研究發(fā)現(xiàn)TRAF4對于調(diào)節(jié)人食管癌CSCs功能至關重要。

“我們的數(shù)學方法可以同時用于鑒定和定量胃腸癌干細胞中導致化療耐藥的潛在靶標。”通訊作者Yuichiro Doki說道?！拔覀兊慕Y(jié)果不僅為針對食管癌靶點的藥物開發(fā)帶來了關鍵信息，還可以用于大規(guī)模篩查CSC藥物治療靶點。”