OGT關(guān)注針對(duì)小型NGS癌癥產(chǎn)品，計(jì)劃推出基于陣列的ce-ivdNIPT
上周，位于英國的Oxfordshire分子遺傳學(xué)公司退出了一款卵巢癌產(chǎn)品和一個(gè)試劑盒，公司的研究和開發(fā)副總裁John Anson表示，這將是一系列基于NGS的產(chǎn)品的第一種。
“這將會(huì)進(jìn)入一個(gè)更具有針對(duì)性和特定疾病的領(lǐng)域，”Anson在采訪中這樣表示。
去年，公司推出了一款針對(duì)60個(gè)實(shí)體瘤基因的面板，這款產(chǎn)品是與南安普頓大學(xué)，伯明翰大學(xué)以及英國分層衛(wèi)生保健計(jì)劃的一部分CIS醫(yī)學(xué)聯(lián)合開發(fā)的。雖然這個(gè)產(chǎn)品包含了范圍廣泛的實(shí)體瘤相關(guān)基因，但是Anson表示，現(xiàn)在公司將關(guān)注更小范圍，更特異的產(chǎn)品。
例如，卵巢癌的產(chǎn)品獎(jiǎng)僅僅靶向7個(gè)基因-BRCA1，BRCA2，TP53，PTEN，ATM，ATR和NF1。公司計(jì)劃研究針對(duì)不同實(shí)體瘤及血液癌癥的靶向產(chǎn)品，并且已經(jīng)提供了一個(gè)25基因的骨髓產(chǎn)品。然而，在未來，Anson說，公司還將研發(fā)針對(duì)特定血液疾病的更小的產(chǎn)品。
他表示，公司現(xiàn)在將NGS產(chǎn)品定位在為轉(zhuǎn)化研究客戶，像醫(yī)院和學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的大型癌癥研究所，這些機(jī)構(gòu)會(huì)使用這些產(chǎn)品來確定預(yù)后標(biāo)記，這些標(biāo)記能夠告知藥物反應(yīng)和新的藥物靶標(biāo)。
“我們想將研究與新的潛在療法聯(lián)系在一起，”他說。
Anson補(bǔ)充說，該公司還將于客戶合作，設(shè)計(jì)一些癌癥產(chǎn)品，以確保包括相關(guān)基因。
NGS癌癥產(chǎn)品市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)尤為激烈。主要的NGS公司-Illumina和Thermo Fisher Scientific-占有大部分癌癥產(chǎn)品市場(chǎng)，安捷倫和RainDance Technologies也做樣品處理，并且許多學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)也自己研發(fā)相關(guān)產(chǎn)品。
盡管如此，Anson表示，OGT擅長于誘餌設(shè)計(jì)，這將幫助與對(duì)手競(jìng)爭(zhēng)。“我們做誘餌設(shè)計(jì)有經(jīng)驗(yàn)化優(yōu)勢(shì)，”他說?！岸粌H僅是依賴于不公可用的軟件?！贝送猓摴具€是用自己的軟件在后臺(tái)進(jìn)行分析。
雖然OGT是一家以芯片而出名的公司，但是其現(xiàn)在已經(jīng)運(yùn)行了超過6000分NGS樣品。
OGT研發(fā)部主任GrahamSpeight表示，公司也將通過整個(gè)靶向區(qū)域提供其維持機(jī)制的產(chǎn)品，甚至包括整個(gè)覆蓋區(qū)域，這對(duì)于某些體細(xì)胞的突變十分重要，因?yàn)樵诼殉舶┑漠a(chǎn)品中，小等位基因的頻率可以低于1%。此外，對(duì)于一些腫瘤抑制基因，例如在卵巢癌的產(chǎn)品中，覆蓋整個(gè)基因是至關(guān)重要的，因?yàn)橥ㄟ^整個(gè)基因的檢測(cè)，可以發(fā)現(xiàn)突變基因，雖然突變往往是集中在突變熱點(diǎn)區(qū)域的?！澳阈枰采w每個(gè)外顯子的堿基，這樣才能得到你需要的靈敏性，”他說。
此外，Anson說，OGT也將提供配套產(chǎn)品。去年，其收購了位于倫敦的基于熒光原位雜交的Cytocell公司。Anson表示，Cytocell熒光原位雜交產(chǎn)品以及OGT的獨(dú)有的細(xì)胞遺傳學(xué)產(chǎn)品是一個(gè)良好的補(bǔ)充?！笆褂迷摷夹g(shù)來看拷貝數(shù)變異和用于SNVs的NGS之間具有一個(gè)良好的交叉作用，”Anson說。
雖然該公司最初關(guān)注的是臨床和轉(zhuǎn)化研究市場(chǎng)，但是其所有的NGS產(chǎn)品僅僅用于研究市場(chǎng)，Anson表示公司現(xiàn)在講著眼臨床市場(chǎng)。
“如果這些檢測(cè)被發(fā)現(xiàn)對(duì)于診斷室重要的，我們將準(zhǔn)備走管理路線，”Anson說?！拔覀円呀?jīng)使用我們的FISH產(chǎn)品完成了一些，并且我們正在努力朝監(jiān)管方向努力?！?/span>
Anson預(yù)計(jì)，癌癥產(chǎn)品可能會(huì)逐漸接近，甚至被機(jī)關(guān)機(jī)構(gòu)批準(zhǔn)，當(dāng)然是指那些關(guān)注在臨床前工作中發(fā)現(xiàn)，對(duì)于治療，診斷和預(yù)后具有相關(guān)性的基因或者特定突變。
除了癌癥，該公司還在研發(fā)美國憲法允許的產(chǎn)品，并且打算進(jìn)入到無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)市場(chǎng)。
在年底之前，OGT計(jì)劃一個(gè)叫做CE-IVD的NIPT申請(qǐng)給歐洲監(jiān)管局，并希望能夠2016年啟動(dòng)該測(cè)試。目前，公司正在進(jìn)行臨床檢測(cè)試驗(yàn)，這項(xiàng)產(chǎn)品獎(jiǎng)主要使用微陣列技術(shù)來篩查唐氏綜合癥。
Anson說，公司決定基于陣列平臺(tái)，而不是NGS的NIPT，這是因?yàn)槠淇梢杂幸粋€(gè)更快的周轉(zhuǎn)時(shí)間和潛在的更低的成本。微陣列NIPT的周轉(zhuǎn)時(shí)間可以在三天內(nèi)輕松完成。目前，NIPT公司提供的基于NGS的檢測(cè)，測(cè)試的周轉(zhuǎn)時(shí)間大概是7-10天。
與其他的產(chǎn)品相類似，OGT計(jì)劃將NIPT做成一個(gè)試劑盒，而不是檢測(cè)服務(wù)。
OGT也提供基于陣列的胚胎移植前的基因篩查檢測(cè)，Anson表示，在可預(yù)見的未來，該公司不會(huì)轉(zhuǎn)化成基于NGS的技術(shù)。
該公司還將關(guān)注基于陣列的用于憲法允許的疾病的研究，然而，Anson表示，基于NGS的產(chǎn)品卡可以補(bǔ)充OGT市場(chǎng)上的基于陣列的產(chǎn)品。當(dāng)前，公司市場(chǎng)主要是醫(yī)學(xué)研究的外顯子陣列，這是由Emory遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室結(jié)合設(shè)計(jì)的。
這個(gè)陣列含有增強(qiáng)的4600個(gè)與醫(yī)療研究相關(guān)的基因，并且這些基因已經(jīng)根據(jù)特異性癥狀進(jìn)行了分組。OGT設(shè)計(jì)其主要是用來與外顯子測(cè)序互補(bǔ)的，EGL對(duì)沖基金執(zhí)行主任Madhuri Hegde表示，OGT的陣列和EGL獨(dú)有的醫(yī)療外顯子檢測(cè)聯(lián)合，可以有更好地針對(duì)缺失和增多的更好效果。
OGT也將關(guān)注一些列其他遺傳疾病的陣列研究，包括自閉癥，杜氏肌萎縮癥，癲癇，智力障礙，聽力喪失和代謝紊亂等。
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