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生物黑客進(jìn)軍基因編輯領(lǐng)域

2015-10-27
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非生物專業(yè)人士已經(jīng)準(zhǔn)備好采用CRISPR技術(shù)嘗試重新編輯基因。

雖然沒有經(jīng)過系統(tǒng)正規(guī)的科學(xué)研究訓(xùn)練,Johan Sosa仍然著迷于一項(xiàng)發(fā)展了十多年的最有前景的分子生物學(xué)工具。


Sosa用過基因編輯工具CRISPR,這個(gè)工具面世才3年,能在體外實(shí)驗(yàn)中對目標(biāo)DNA進(jìn)行編輯。下周,他希望用這個(gè)技術(shù)對酵母基因進(jìn)行編輯,隨后再繼續(xù)對模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana)進(jìn)行基因改造。

鑒于CRISPR技術(shù)的簡單和普遍適用性,科學(xué)家們通過這項(xiàng)技術(shù)能比以前更加簡單地對基因序列進(jìn)行特定改變。研究者們已經(jīng)采用CRISPR技術(shù)編輯從細(xì)菌到人類胚胎的各種基因。這項(xiàng)技術(shù)有清除家族性遺傳病變異基因,以及用前所未有的方式治療腫瘤,或者在豬體內(nèi)培植人類的器官的潛力。有一位研究人員甚至建議修飾大象基因組,以重新創(chuàng)造出早已滅絕的、能適應(yīng)寒冷氣候的猛犸。

CRISPR的這些潛在應(yīng)用目前還不能為生物黑客所用。生物黑客是一群數(shù)量不斷增長的業(yè)余生物學(xué)家,他們經(jīng)常在社區(qū)的實(shí)驗(yàn)室工作,一般是需要交費(fèi)才能使用實(shí)驗(yàn)儀器和耗材,但是CRISPR技術(shù)不用收費(fèi)。創(chuàng)新精神激發(fā)他們利用這種技術(shù)編輯酵母基因以改變啤酒的口味,從細(xì)菌中構(gòu)建藝術(shù)品以及研究重要的基礎(chǔ)科學(xué)問題,這些業(yè)余生物學(xué)家已經(jīng)迫不及待了。

住在都柏林的生物黑客和企業(yè)家Andreas Stürmer指出,CRISPR是有史以來最了不起的工具,任何人都可以在自己的家里做實(shí)驗(yàn)。

Sosa是加州SanJose的一個(gè)IT顧問,3年前他希望在實(shí)驗(yàn)室里培植出器官,或者其它人體的部分,此后生物黑客就成為了他的業(yè)余愛好。起初他不知道這個(gè)目標(biāo)多么不切實(shí)際,他以為就是拿到一些干細(xì)胞然后給它們加?xùn)|西就可以了。

像Johan Sosa一樣的生物黑客在發(fā)掘分子生物學(xué)的創(chuàng)造性潛能。

操作活細(xì)胞的挑戰(zhàn)促使他開始閱讀分子生物學(xué)教材、參加一些講座,并自學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)。他還參加了加州Sunnyvale市的BioCurious社區(qū)實(shí)驗(yàn)室。

Sosa還不確定他掌握了CRISPR技術(shù)后會用它做什么。他可能會參加BioCurious的小組活動,對酵母進(jìn)行改造,讓酵母能產(chǎn)生酪蛋白。這種蛋白在牛奶中大量存在,這樣或許能用酵母直接制造出素食奶酪。這些可能會用到CRISPR技術(shù)去研究在不同種類的酵母中蛋白是如何被化學(xué)修飾的。他指出,目前他們能做的實(shí)驗(yàn)跟一些大型著名實(shí)驗(yàn)室里能做的一樣,這真讓人興奮。

東京大學(xué)(University of Tokyo)生物數(shù)據(jù)可視化研究員Artist Georg Tremmel對使用CRISPR技術(shù)有清晰的計(jì)劃。他和合作者計(jì)劃利用這種技術(shù)把日本銷售的經(jīng)基因改造的藍(lán)色康乃馨去除插入的基因,恢復(fù)成天然的白色。他們希望其他人能考慮,這種經(jīng)過雙重基因改造的康乃馨與未經(jīng)基因改造的有同樣基因組的康乃馨有否不同。

Tremmel表示,目前為止,這一改造基因計(jì)劃中最復(fù)雜的技術(shù)不是CRISPR,而是康乃馨細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)。另外一個(gè)挑戰(zhàn)是得到展示這項(xiàng)研究成果的許可,因?yàn)楸M管藍(lán)色康乃馨在日本允許銷售,但這種脫基因改造白色康乃馨若要上市,則需要經(jīng)過許可。

除了富有創(chuàng)造性的可能,CRISPR也有潛在的生物危險(xiǎn)性。美國聯(lián)邦調(diào)查局生物恐怖主義小組在過去幾年中曾潛入生物黑客社區(qū),反復(fù)提醒其成員留意是否存在可疑生物恐怖活動。華盛頓智庫威爾遜中心的科學(xué)政策研究人員Todd Kuiken指出,這些擔(dān)憂可能沒有必要,大多數(shù)生物黑客有善意的目標(biāo),比如創(chuàng)建五顏六色的細(xì)菌或釀造特色啤酒。

此外,Kuiken還表示,對于一個(gè)典型的DIY生物學(xué)家所能做的也有過度的預(yù)計(jì)。實(shí)驗(yàn)試劑,如酶和抗體非常昂貴,分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)非常耗時(shí),而那些實(shí)驗(yàn)儀器和專業(yè)的科學(xué)家也是有經(jīng)費(fèi)支持的,這些常常是個(gè)人或社區(qū)實(shí)驗(yàn)室不具備的。大多數(shù)社區(qū)實(shí)驗(yàn)室堅(jiān)持聲明他們開展的研究都是生物安全要求最低級別的,他們不使用人體細(xì)胞和病原體。然而在歐洲的部分地區(qū),在專業(yè)實(shí)驗(yàn)室以外開展基因編輯實(shí)驗(yàn)屬于非法。

加利福尼亞州亨廷頓海灘16歲的生物黑客和科學(xué)競賽冠軍KeoniGandall指出,考慮到對DIY實(shí)驗(yàn)室的限制,很多愛好者只有在需要非常精確地改變基因組時(shí)才會考慮使用CRISPR,而他已經(jīng)在家使用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)機(jī)和離心機(jī)做實(shí)驗(yàn)近三年了。目前為止,Gandall只在當(dāng)?shù)卮髮W(xué)實(shí)驗(yàn)室做志愿者時(shí)使用過CRISPR技術(shù),他說感覺非常棒。

對于CRISPR技術(shù)最大的擔(dān)憂之一是有人利用這項(xiàng)技術(shù)通過基因改造制造出能在人群中傳播異常迅速的病原體。但洛杉磯生物黑客、環(huán)境律師Dan Wright認(rèn)為,大多數(shù)業(yè)余生物研究者目前還沒有這種能力,構(gòu)建出這樣一個(gè)系統(tǒng)將超出正在考慮相對簡單的問題的他和他的同事們的能力范圍。對此,Wright表示,這太難了,目前僅是敲除掉一種植物的一個(gè)基因?qū)τ谏锖诳蛡円咽呛艽蟮奶魬?zhàn)了。
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