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美問(wèn)必答 | 攻克難關(guān):小核酸藥物研發(fā)突破指南

2024-08-07
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美問(wèn)必答 | 攻克難關(guān):小核酸藥物研發(fā)突破指南

小核酸藥物相較于傳統(tǒng)的小分子化合物和抗體藥物,具有更高的靶向性和特異性,這使得它們能夠更有效地調(diào)控特定基因的表達(dá),為治療各種疾病提供了新的途徑,在癌癥、遺傳性疾病以及病毒感染等方面展現(xiàn)出了巨大的潛力。然而,小核酸藥物的研究也面臨著一些重要挑戰(zhàn)。當(dāng)前,研究人員正致力于提高藥物的穩(wěn)定性,并優(yōu)化其靶向性,以期能夠更好地利用小核酸藥物的治療優(yōu)勢(shì)。

美迪西云講堂邀請(qǐng)?jiān)诨瘜W(xué)領(lǐng)域經(jīng)驗(yàn)豐富的田寶泉博士,為大家解答小核酸藥物研發(fā)過(guò)程中的常見(jiàn)問(wèn)題。并帶您把握前沿動(dòng)態(tài),共同探討小核酸藥物的無(wú)限可能。

點(diǎn)擊鏈接“http://www.7080m.com/video/small-nucleic-acid-opportunities.shtml”,回顧田寶泉博士的整場(chǎng)直播。

01 您好,請(qǐng)問(wèn)您認(rèn)為小核酸藥物研發(fā)目前的難點(diǎn)在哪里?

田寶泉博士:在小核酸藥物研發(fā)過(guò)程中,涉及多個(gè)關(guān)鍵步驟。首先是序列的篩選和優(yōu)化,設(shè)計(jì)小核酸藥物并不簡(jiǎn)單,需要考慮其與非靶向基因的非特異性結(jié)合及可能出現(xiàn)的脫靶效應(yīng)。由于許多mRNA具有不同的轉(zhuǎn)錄本,必須仔細(xì)研究其不同之處,以避免剪接時(shí)靶基因序列的漏失。因此,序列篩選通常需要進(jìn)行大規(guī)模篩選,以確保在靶基因的不同位點(diǎn)都有合適的候選化合物,這是一個(gè)技術(shù)難點(diǎn)。

其次是化學(xué)修飾,目前的化學(xué)修飾已能基本解決小核酸穩(wěn)定性的問(wèn)題。然而,隨著臨床數(shù)據(jù)的積累,必須不斷發(fā)展化學(xué)修飾技術(shù),以保持競(jìng)爭(zhēng)力并避免被新一代藥物取代。另一個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)是遞送系統(tǒng),遞送系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)面臨著巨大的技術(shù)挑戰(zhàn),尤其是針對(duì)肝外靶向遞送系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)。目前適應(yīng)癥較為狹窄,為了促進(jìn)小核酸藥物的快速發(fā)展,必須擴(kuò)大其適應(yīng)癥范圍。

最后,小核酸藥物的藥效、藥代和毒理評(píng)估也是關(guān)鍵步驟。由于其特殊的性質(zhì)以及國(guó)內(nèi)并無(wú)上市的小核酸藥物,探索準(zhǔn)確評(píng)估小核酸藥物的安全性和有效性的評(píng)價(jià)方法同樣具有挑戰(zhàn)性。此外,后續(xù)生產(chǎn)工藝的后期放大和成本控制也是小核酸藥物研發(fā)中不可忽視的難題。

在國(guó)內(nèi),小核酸藥物的研發(fā)正處于初步階段,建立高效安全的評(píng)估體系尤為重要。這些問(wèn)題都需要科研人員一一關(guān)注和不斷的完善和解決。

02 糖環(huán)并四元環(huán)的核苷酸單體有在臨床應(yīng)用嗎?是否只有臨床前研究?個(gè)人覺(jué)得這個(gè)類(lèi)型的核苷單體成本太高,是否不太具備性價(jià)比?

田寶泉博士:目前已有文獻(xiàn)報(bào)道糖環(huán)并四元環(huán)的存在。在臨床應(yīng)用方面,有關(guān)于5’糖環(huán)并四元環(huán)破5‘-(E)-VP的專(zhuān)利,確實(shí)有一些已經(jīng)應(yīng)用于臨床。然而,目前僅有這些例子,糖環(huán)并四元環(huán)在核糖本身的,在臨床上尚未應(yīng)用。在小核酸藥物中,核糖成環(huán)狀結(jié)構(gòu)的鎖核酸在ASO藥物中確實(shí)有應(yīng)用,例如采用gapmer結(jié)構(gòu)的ASO藥物中使用到了鎖核酸的單體。、

關(guān)于價(jià)格高的問(wèn)題確實(shí)存在,但是隨著產(chǎn)業(yè)化的進(jìn)程,成本的問(wèn)題是能夠解決的,例如我們?cè)谘邪l(fā)過(guò)程中,起初幾千元一克的單體化合物已降至現(xiàn)在的約300元一克,工藝研發(fā)部門(mén)正在努力進(jìn)一步降低成本。新型的核苷酸單體一旦開(kāi)發(fā)成功,根據(jù)小核酸研發(fā)的平臺(tái)優(yōu)勢(shì)作用,可在多個(gè)管線應(yīng)用,成本相對(duì)分?jǐn)偤髮⒉辉偈侵饕獑?wèn)題。在新藥開(kāi)發(fā)中,化學(xué)修飾的選擇至關(guān)重要,雖然核酸單體的開(kāi)發(fā)成本需謹(jǐn)慎考慮,但技術(shù)和平臺(tái)的進(jìn)步使得化學(xué)修飾成為可行的選項(xiàng)。

03 單體的純度對(duì)寡核苷酸合成純度的影響?

田寶泉博士:確實(shí)是有影響,在我們的前期篩選階段,通常對(duì)純度的要求并不十分嚴(yán)格,有時(shí)候即使是95%的純度也能夠接受,98%的也是可以。然而,當(dāng)進(jìn)入后期工藝放大階段時(shí),即便是99%的純度,如果單體中單雜含量超過(guò)了0.5%,會(huì)對(duì)后續(xù)純化工藝造成顯著的成本增加。因此,在單體質(zhì)量控制方面,尤其是在工藝研發(fā)階段,嚴(yán)格控制質(zhì)量是必不可少的。

04 最近酶法合成寡核苷酸技術(shù)有所突破,對(duì)固相合成有影響?

田寶泉博士:是的,近期在寡核苷酸合成領(lǐng)域,酶法技術(shù)取得了顯著進(jìn)展。Alnylam等公司一直在推動(dòng)酶法的固相合成方法,我參考的專(zhuān)利顯示,不同于一次性合成,他們采用分段的方法,先將幾個(gè)單體用固相法合成,再利用酶法特異性連接起來(lái)。酶法合成技術(shù)是否繼續(xù)發(fā)展尚不得而知,但它已經(jīng)可以與傳統(tǒng)固相合成技術(shù)相比擬。在小規(guī)模合成中,酶法與固相合成技術(shù)表現(xiàn)相當(dāng),但要實(shí)現(xiàn)大規(guī)模生產(chǎn),目前仍主要依賴固相合成。

當(dāng)然,未來(lái)酶法技術(shù)的發(fā)展?jié)摿薮?。兩三年前,也有人?wèn)起酶法合成小核酸藥物的可行性,那個(gè)時(shí)候確實(shí)只有固相合成這一個(gè)途徑,而現(xiàn)在情況可能已有所不同。

05 初篩序列的時(shí)候是否需要進(jìn)行修飾?

田寶泉博士:初篩的時(shí)候不需要修飾,在研發(fā)過(guò)程中,初始篩選階段通常使用未修飾的裸序列。修飾通常在確認(rèn)敲低率良好的序列后進(jìn)行,因?yàn)槿粜揎椃椒ú划?dāng),可能會(huì)導(dǎo)致敲除率嚴(yán)重下降。因此,我們不會(huì)在未經(jīng)篩選的序列上直接進(jìn)行修飾,以免增加其篩選失敗的風(fēng)險(xiǎn)。

如果擔(dān)心序列的穩(wěn)定性問(wèn)題,可以選擇例如在3’端添加dTdT以增加其穩(wěn)定性。通常情況下凍干粉形式的裸序列可以保持?jǐn)?shù)月,而溶液狀態(tài)下保持?jǐn)?shù)周,其生物藥效也不會(huì)產(chǎn)生大的改變。因此,在初期篩選階段通常無(wú)需進(jìn)行修飾,可以直接用裸序列進(jìn)行篩選工作。

06 序列一開(kāi)始就進(jìn)行修飾設(shè)計(jì)的,和裸序列設(shè)計(jì)篩選后在修飾,哪一種更推薦?

田寶泉博士:建議首先進(jìn)行裸序列的篩選。即使裸序列篩選工作良好,如果后續(xù)的修飾方法不當(dāng),體外往往無(wú)法表現(xiàn)出預(yù)期的效果,這種情況在實(shí)踐中非常多見(jiàn)。因此,推薦先對(duì)裸序列進(jìn)行篩選,然后再考慮進(jìn)行修飾。首先確定一個(gè)優(yōu)秀的裸序列,然后在此基礎(chǔ)上進(jìn)行不同的修飾,以驗(yàn)證哪種修飾方法能夠保持其活性。

07 固相合成PS轉(zhuǎn)PO高怎么辦?

田寶泉博士:按照我的理解,在固相合成的時(shí)候,對(duì)于磷硫?;磻?yīng)后,確實(shí)會(huì)有磷酰化的。ASO藥物通常全部使用硫代是比較安全的,而siRNA藥物則僅在鏈端使用硫代基團(tuán)。在鏈端個(gè)別磷酸硫代完后還要多次做磷酰化,因?yàn)闊o(wú)論是硫代還是磷?;磻?yīng),都從亞磷酰胺轉(zhuǎn)化而來(lái),而亞磷酰胺非常活躍。在磷酰化過(guò)程中,很容易發(fā)生硫代被氧化,這可能導(dǎo)致硫代磷?;膯误w重新被氧化成磷酸。因?yàn)榱姿崾峭ㄟ^(guò)碘氧化來(lái)引入的,這個(gè)過(guò)程中,需要精確控制氧化劑在固相柱上的停留時(shí)間,以確保反應(yīng)迅速進(jìn)行。如果控制不當(dāng),可能會(huì)導(dǎo)致硫代磷酸再次轉(zhuǎn)化為磷酸。

如果您對(duì)于新藥研發(fā)臨床前研究過(guò)程中有一些困惑或者想要深入了解的專(zhuān)題內(nèi)容,可以評(píng)論區(qū)留下您的問(wèn)題和建議,美迪西希望和您一起,探索新藥研發(fā)的奇妙世界。

核酸藥物研發(fā)平臺(tái)

美迪西核酸藥物研發(fā)平臺(tái)是集成了藥物發(fā)現(xiàn)、生產(chǎn)和臨床前研究的一體化綜合性平臺(tái)。基于嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)態(tài)度、開(kāi)放的技術(shù)平臺(tái)和先進(jìn)的儀器設(shè)備,我們可以滿足行業(yè)對(duì)于前沿創(chuàng)新核酸藥物的研發(fā)需求,承接醫(yī)藥公司及科研單位的核酸藥物發(fā)現(xiàn)、篩選及臨床前研究服務(wù)。

核酸藥物合成&修飾:

美迪西核苷酸藥物化學(xué)合成平臺(tái)可以提供單體合成、修飾;寡核苷酸合成;遞送系統(tǒng)合成以及寡核苷酸偶聯(lián)物的合成。已經(jīng)建成的siRNA庫(kù),不僅有豐富的單體庫(kù)存,而且擁有龐大的單體合成砌塊庫(kù),可以快速完成各類(lèi)修飾單體的合成。美迪西擁有專(zhuān)業(yè)的小核酸藥物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)可以提供高效快捷地研發(fā)服務(wù);已有多個(gè)siRNA藥物FTE項(xiàng)目完成和進(jìn)行中。

核酸藥物CMC研究

在寡核苷酸藥物開(kāi)發(fā)過(guò)程中,藥學(xué)方面的挑戰(zhàn)主要是寡核苷酸大規(guī)模生產(chǎn)能力和分析與質(zhì)控能力要求高,大規(guī)模生產(chǎn)對(duì)單體原料、設(shè)備、合成工藝及純化方面都有很高要求。制劑方面的挑戰(zhàn)在于制備LNP(GalNac技術(shù)的小核酸除外)的難度高;分析方面挑戰(zhàn)在于寡核苷酸的有關(guān)物質(zhì)與活性成分本身的結(jié)構(gòu)相似性大,質(zhì)量研究與控制需要多原理不同手段的分析方法進(jìn)行,除了一般注射劑研究外還要進(jìn)行LNP的包封率測(cè)定等。美迪西在siRNA等寡核苷酸藥物方面的CMC服務(wù)項(xiàng)目已啟動(dòng)。

核酸藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)

在寡核苷酸藥物開(kāi)發(fā)過(guò)程中,藥效學(xué)方面的挑戰(zhàn)包括:靶向不足導(dǎo)致靶部位的寡核苷酸藥物濃度低導(dǎo)致給藥劑量不斷增高;寡核苷酸藥物與非靶 RNA 結(jié)合引發(fā)的脫靶毒性等。美迪西在核酸藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)方面經(jīng)驗(yàn)豐富,提供不同用藥途徑的比較(如靜脈注射,瘤內(nèi)局部注射)、體內(nèi)藥效與靶標(biāo)mRNA/蛋白質(zhì)降解(PD)和寡核苷酸藥物的系統(tǒng)暴露量(PK)的相關(guān)性分析等等。

核酸藥物藥代動(dòng)力學(xué)研究

在寡核苷酸藥物開(kāi)發(fā)過(guò)程中,藥代動(dòng)力學(xué)PK方面的挑戰(zhàn)也是此類(lèi)藥物較大的難題。未經(jīng)修飾的寡核苷酸類(lèi)藥物成藥性不佳、PK特性差、穩(wěn)定性差、容易被核酸酶降解、分布特性差、和靶標(biāo)的結(jié)合力不佳、生物分析方法開(kāi)發(fā)難度大等。美迪西藥代動(dòng)力學(xué)團(tuán)隊(duì)具備完善的寡核苷酸生物分析平臺(tái)、肝臟活體穿刺、肌肉活檢和鞘內(nèi)注射平臺(tái)用于PK和PK/PD研究。

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