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新聞資訊

蛋白質(zhì)圖譜盲點(diǎn)清單

2018-03-07
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后基因組時(shí)代,蛋白質(zhì)序列有了,《Nucleic Acids Research》文章論述蛋白質(zhì)的實(shí)際功能遠(yuǎn)非序列所能描述。


每個(gè)生物體有擁有一張構(gòu)建自我生存所需蛋白質(zhì)的藍(lán)圖。多虧了蛋白質(zhì)圖譜計(jì)劃,人們現(xiàn)在已經(jīng)知道了大多數(shù)蛋白質(zhì)在這些藍(lán)圖上的定位。遺憾的是,我們?nèi)匀徊磺宄蠖鄶?shù)蛋白質(zhì)在體內(nèi)的實(shí)際作用。

盧森堡大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究中心的實(shí)驗(yàn)和計(jì)算科學(xué)家跨學(xué)科研究團(tuán)隊(duì)在《Nucleic Acids Research》發(fā)表文章,系統(tǒng)性地定量和定性了這之間存在的差異究竟有多大,并列出了酵母和人類細(xì)胞中有待探索的蛋白酶清單。

通過這項(xiàng)研究,科學(xué)家們前所未有地預(yù)測了在未知功能的蛋白質(zhì)中有多少是酶,它們是活細(xì)胞用來處理每秒鐘數(shù)以千計(jì)的化學(xué)反應(yīng)的工具?!拔覀儼l(fā)現(xiàn)酵母和人體中約30%的‘未知’蛋白都是曾經(jīng)被我們忽略的酶類,”“酶學(xué)和代謝學(xué)”研究項(xiàng)目的帶頭人Carole Linster博士說。

因?yàn)樵S多疾病,特別是遺傳代謝性疾病都跟基因缺陷導(dǎo)致的蛋白質(zhì)錯(cuò)誤折疊或不生產(chǎn)某些酶有關(guān),研究人員希望通過分析基因序列和這些酶類圖譜找到解決疾病發(fā)病和發(fā)展的觸發(fā)因素?!拔覀円呀?jīng)破譯了成千上萬個(gè)來自不同物種的基因組,也知道它們翻譯成什么蛋白質(zhì),”Linster說。但是從我們的分析中可以看出,機(jī)體生產(chǎn)的所有蛋白質(zhì)中,大約有三分之一我們都無法確定它們?cè)谏矬w內(nèi)的真實(shí)功能。在蛋白質(zhì)圖譜上,它們就像大量的沒被點(diǎn)亮的盲點(diǎn)?!?br />
當(dāng)考古學(xué)家找到了一份來自遠(yuǎn)古的筆跡,他可能認(rèn)識(shí)文中所有單獨(dú)的字母,但這并不代表他可以理解整篇文章,在理解全文之前,他先要弄清楚單詞的含義。“生物學(xué)家們調(diào)查罕見遺傳疾病的病因與此情況非常相似,想知道基因缺陷如何影響機(jī)體,僅僅知道它們的基因序列發(fā)生了哪些改變是不夠的?!?br />
接下來,Linster博士和他的同事們準(zhǔn)備更詳細(xì)地了解這些不為人知的蛋白質(zhì)的功能,以解開生命蛋白質(zhì)奧秘的全部謎題。
部分代謝酶鑒定實(shí)驗(yàn)和計(jì)算策略
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